UGTLDUGT LAB FOR DISCOVERY

PUBLIC RESOURCE DIRECTORY

了解研究输入,也了解它们的来源边界。

UGTLD 使用多类分子与生物学资源组织候选研究。本页说明可公开访问的资源类型与数据准备要求,不宣称平台已收录未核实的数据规模或覆盖范围。

资源地图

SPECIES

物种与基因组背景

记录学名、分类标识、基因组组装、注释版本和来源,避免将不同物种或注释版本的基因模型混用。

UGT

序列与功能注释

以稳定 Gene / Protein ID 连接 FASTA、家族、PSPG、系统发育位置、参考序列和注释来源。

COMPOUNDS

受体与糖供体

使用稳定化合物标识、SMILES 或结构文件,并注明立体化学、质子化与研究假设。

输入准备与核验重点

资源能否用于一项分析,取决于身份映射、版本和实验语境,而不只是文件格式可读。

OMICS

表达与组学

提供矩阵、单位、归一化方式、组织、处理、重复、批次和基因标识映射。保留未匹配项目;缺失值不能填成零。

STRUCTURE

结构与复合体

注明实验结构或模型来源、残基编号映射、质量指标、配体身份、方法版本和原始 Artifact。预测质量不代表功能确认。

数据范围:

公开页面只列举资源类型与第三方公共入口。授权项目资源按项目 ACL 隔离,不会因登录公开页而对其它用户开放。

常用第三方公共入口

这些资源由各自机构维护;链接不表示 UGTLD 与其存在合作,也不代表所有记录均已导入平台。

SEQUENCE

UniProt

蛋白序列、功能注释与文献。保存 accession、review status 与访问版本。

PLANT GENOMICS

Ensembl Plants

植物基因组与基因模型。组装和基因注释版本应成对记录。

STRUCTURE

RCSB PDB

实验结构及配体语境。核对分辨率、缺失片段和 biological assembly。

CHEMISTRY

PubChem

化合物标识与结构。名称相同不保证立体化学实体相同。

公共数据与项目数据分开管理

PUBLIC公开可查资源

外部研究者可按来源许可查询的数据库和通用方法文档。

PROJECT项目输入与分析结果

由项目 ACL 控制的序列、组学、结构、任务和报告。

PROVENANCE来源与许可记录

保留获取时间、版本、许可、映射和数据处理说明。